涉農專項資金由于具有其固有的特點,因此,在撥付、使用和管理方面存在著以下問題:
(一)項目立項不科學,必要性和可行性差;立項前期費用大 ,成本高。
(二)項目點多面廣,資金撥付和使用鏈條長,環節多,往往是資金撥付滯后,項目得不到及時有效地實施,影響涉農資金效益的發揮。
(三)由于農業專項資金具有無償性,個別單位和主管部門隨意開口子,任意截留、擠占、挪用、回轉,農業專項資金不能及時足額到位,項目得不到完整有效地實施。
(四)一些農業專項資金未按批準的項目實施方案進行實施,擅自變更實施內容。
(五)一些主管部門(單位)受部門利益驅動和缺乏責任心,在項目實施過程中,仍存在變相增加農民負擔,損害農民利益的行為。因此,必須強化對涉農專項資金的審計監督。