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    高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定的審計(jì)包括： 
　　1、經(jīng)具有資質(zhì)并符合本《工作指引》相關(guān)條件的中介機(jī)構(gòu)鑒證的企業(yè)近三個(gè)會(huì)計(jì)年度研究開發(fā)費(fèi)用（實(shí)際年限不足三年的按實(shí)際經(jīng)營(yíng)年限）、近一個(gè)會(huì)計(jì)年度高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告； 
　　2、經(jīng)具有資質(zhì)的中介機(jī)構(gòu)鑒證的企業(yè)近三個(gè)會(huì)計(jì)年度的財(cái)務(wù)報(bào)表（含資產(chǎn)負(fù)債表、利潤(rùn)及利潤(rùn)分配表、現(xiàn)金流量表，實(shí)際年限不足三年的按實(shí)際經(jīng)營(yíng)年限）。
    高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定審計(jì)中關(guān)注的主要問(wèn)題：
    1.研究開發(fā)人員的判定。企業(yè)研發(fā)人員工資薪酬在整個(gè)研發(fā)費(fèi)用中占有較大比重，因而，準(zhǔn)確界定研發(fā)人員，對(duì)認(rèn)定專項(xiàng)審計(jì)來(lái)說(shuō)非常重要。
    2.研發(fā)費(fèi)用的歸集與分配。　　
    （1）研發(fā)費(fèi)用與其他生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)支出相區(qū)分。　　
    （2）研發(fā)費(fèi)用按項(xiàng)目進(jìn)行明細(xì)核算。
    （3）合理確定研發(fā)費(fèi)用的分配標(biāo)準(zhǔn)。
    ①企業(yè)多個(gè)研發(fā)項(xiàng)目共用一些研發(fā)設(shè)備與儀器，折舊費(fèi)用在各項(xiàng)目間的分?jǐn)傄罁?jù)的確定。②企業(yè)存在多個(gè)研發(fā)項(xiàng)目，研發(fā)人員的項(xiàng)目分工。
    3.高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入的確認(rèn)。
    高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入應(yīng)當(dāng)占當(dāng)年總收入的60%以上。